基因检测已是疟原虫虫种鉴定的可靠方法，因此被广泛用于镜检诊断疟疾的核实和疟疾流行的监测，但目前仍缺乏对不同疟原虫株间基因差异进行鉴定的方法，而DNA条形码分子鉴定法能够进行生物系统演化关系分析的功能有望实现对疟原虫株进行分子层面上的分辨。

    2016年，以云南省寄防所中心实验室人员为研究团队的《云南省疟原虫多重药物抗性基因分布特点及不同类群疟原虫的基因条形码鉴定研究》项目，获得国家自然科学基金资助立项以开展云南省疟疾疫情病例的疟原虫基因指纹研究。目前，课题组已发现，云南疫情病例的恶性疟原虫分离株的富组氨酸蛋白（Plasmodium falciparum histidine-rich protient-2, Pfhrp-2）基因、裂殖子表面蛋白（Plasmodium vivax merozoite surface protein-1, Pvmsp-1）基因、环子孢子蛋白（Circumsporozoite protein，CSP）基因均存在较丰富的多态性，其中，恶性疟原虫Pfhrp-2基因存在104种单倍型，He、H分别为 0.1870和0.9828；Pvmsp-1存在66种单倍型，缅甸、非洲间日疟原虫种群的He分别为0.3024和0.7638，云南本地虫株的He为0.5683；Pvcsp存在12种单倍型，He、H分别为0.20036和0.9412。这些结果提示，云南省疫情病例的疟原虫结构蛋白和功能蛋白的基因多态是明显的，且存在较好的产生规律，所以具有作为基因指纹的潜力。

                                         (中心实验室 供稿)